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代謝是生命體的基本特征，代謝紊亂跟多種重大疾病密切相關。目前基于質(zhì)譜的非靶向代謝組學研究大多是“靜態(tài)分析”，即在某個時間點采樣分析，難以測定生物體內(nèi)代謝物合成和降解等動態(tài)變化規(guī)律。代謝流分析技術通常采用穩(wěn)定同位素示蹤 (Stable-isotope tracing) 實驗來追蹤穩(wěn)定同位素在代謝物中的流向，進而通過測定代謝網(wǎng)絡中代謝物的同位素分布來計算代謝物合成和降解等動態(tài)變化規(guī)律。但是，當前代謝流分析大多只靶向分析特定的代謝通路，如糖酵解、三羧酸循環(huán)、氨基酸代謝、脂肪酸代謝等，難以全面地對整個代謝組的動態(tài)變化進行大范圍檢測和解析，且限制了發(fā)現(xiàn)新的代謝通路和代謝反應。為了對生命體的整個代謝組進行全面的代謝流動態(tài)分析，朱正江課題組結合了前期發(fā)展的大規(guī)模代謝物結構鑒定技術MetDNA（Nature Communications, 2019, 10: 1516）和穩(wěn)定同位素標記代謝物檢測技術，發(fā)展了基于穩(wěn)定同位素標記的非靶向代謝流組學技術MetTracer。該技術具有以下特點：1，追蹤覆蓋范圍高，能夠對上千個代謝物同時進行穩(wěn)定同位素標記的追蹤；2，對穩(wěn)定同位素標記代謝物的定量準確性高且可重復性好；3，大規(guī)模數(shù)據(jù)分析的假陽性低。

圖1. 基于穩(wěn)定同位素標記的代謝流組學技術MetTracer。（圖片來源：Nature Communications）

果蠅是衰老研究中常用的模式動物。該工作首先用[U-¹³C]-葡萄糖喂養(yǎng)果蠅，然后解剖果蠅的腦組織和肌肉組織進行非靶向代謝流組學的分析，在腦組織和肌肉組織中分別追蹤到390個和597個標記的代謝物。通過多個時間點標記程度的聚類分析表征了代謝物可以根據(jù)標記速率分為高、中、低標記速率三類，分別富集于糖相關代謝、氨基酸相關代謝和嘌呤代謝脂肪酸合成等代謝通路。該工作重點對年輕果蠅和衰老果蠅進行了代謝穩(wěn)態(tài)變化的系統(tǒng)性分析。相關研究發(fā)現(xiàn)，衰老能夠調(diào)控代謝物之間的代謝關聯(lián)，在果蠅衰老過程中，腦組織內(nèi)、肌肉組織內(nèi)、腦組織和肌肉組織間關聯(lián)代謝物數(shù)目均有明顯降低，即衰老伴隨著系統(tǒng)層面的組織內(nèi)和組織間的代謝穩(wěn)態(tài)丟失。值得一提的是，該工作還發(fā)現(xiàn)果蠅衰老過程中存在糖酵解代謝減弱、絲氨酸代謝增強的代謝轉變，這為衰老相關的代謝調(diào)控研究提供了新的思路和潛在干預手段。

圖2. 果蠅衰老過程中的代謝穩(wěn)態(tài)變化。（圖片來源：Nature Communications）

為了方便生命科學領域研究者處理穩(wěn)定同位素標記的代謝流組學數(shù)據(jù)，課題組提供了docker供學術界用戶免費使用MetTracer軟件（https://hub.docker.com/r/zhulab/mettracer-r）。該工作所開發(fā)的非靶向代謝流組學技術MetTracer已經(jīng)申請了國家發(fā)明專利，MetTracer軟件也申請了國家軟件著作權的保護。相關技術和軟件的商業(yè)用途需要聯(lián)系朱正江研究員進行授權使用。

該工作得到了國家自然科學基金委、科技部、中國科學院、上海市科委等的資助。

論文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-022-31268-6