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Nat. Chem.:醛催化α-氨基酸的14C,13C,11C同位素標(biāo)記

來(lái)源:化學(xué)加原創(chuàng)      2022-11-19
導(dǎo)讀:近日,加拿大渥太華大學(xué)(University of Ottawa)Benjamin H. Rotstein和阿爾伯塔大學(xué)(University of Alberta)Rylan J. Lundgren課題組發(fā)展了在芳基醛催化下,利用*CO2實(shí)現(xiàn)了α-氨基酸的14C,13C或11C標(biāo)記過(guò)程。反應(yīng)對(duì)大多數(shù)蛋白質(zhì)氨基酸以及非天然氨基酸底物均可兼容。此方法可以避免對(duì)羧酸進(jìn)行預(yù)活化或在分子上預(yù)先安裝官能團(tuán)即可實(shí)現(xiàn)α-氨基酸碳同位素標(biāo)記,在藥物研發(fā)和醫(yī)療領(lǐng)域具有中重要的應(yīng)用價(jià)值。相關(guān)成果發(fā)表在Nat. Chem.上,文章鏈接DOI:10.1038/s41557-022-01074-0。

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(圖片來(lái)源:Nat. Chem.

α-氨基酸是構(gòu)成生命體的基本化學(xué)物質(zhì)之一。同位素標(biāo)記的α-氨基酸及其衍生物廣泛應(yīng)用于生物化學(xué)、定量蛋白質(zhì)組學(xué)、吸收分布代謝和排泄(ADME)分析中。此外,其還可以作為正電子發(fā)射斷層掃描(PET)技術(shù)的顯像劑。因此,發(fā)展簡(jiǎn)潔高效的同位素標(biāo)記方法來(lái)快速實(shí)現(xiàn)α-氨基酸的標(biāo)記具有重要意義。而在同位素標(biāo)記中,通常會(huì)更傾向于使用碳同位素標(biāo)記而不是氫同位素(2H或3H),因?yàn)樘纪凰夭蝗菀?/span>消除,也不會(huì)引起代謝轉(zhuǎn)移。此外,碳同位素標(biāo)記分子的固有結(jié)構(gòu)也不會(huì)像18F標(biāo)記那樣發(fā)生改變。盡管經(jīng)過(guò)了70多年的研究,含有碳同位素α-氨基酸的合成仍然具有很大的挑戰(zhàn)性。其通常涉及將*C引入到分子前體中,然后進(jìn)行多步合成來(lái)實(shí)現(xiàn)(Fig. 1a)。

二氧化碳是所有碳同位素標(biāo)記試劑的主要來(lái)源。目前由于缺乏有效的*CO2捕獲方法,因此現(xiàn)階段很難在分子后期標(biāo)記應(yīng)用過(guò)程中使用*CO2來(lái)進(jìn)行標(biāo)記。

自然界通常利用脫羧酶來(lái)促使α-氨基酸釋放CO2,其通過(guò)與磷酸吡哆醛縮合可以將氨基酸轉(zhuǎn)化為希夫堿(亞胺)(Fig. 1b)。而利用小分子催化α-氨基酸的脫羧過(guò)程也是可以進(jìn)行的,但其通常僅在高溫(150 °C)下發(fā)生,因此制約了其與*CO2的羧基交換反應(yīng)的發(fā)展。因此,發(fā)展在溫和條件下,利用*CO2實(shí)現(xiàn)α-氨基酸的C1標(biāo)記具有重要意義。

基于由α-氨基酸衍生的亞氨基羧酸會(huì)在D2O存在時(shí)傾向發(fā)生α-H/D交換過(guò)程,以及在多種情況下會(huì)發(fā)生可逆的脫羧過(guò)程。最近,加拿大渥太華大學(xué)(University of OttawaBenjamin H. Rotstein和阿爾伯塔大學(xué)University of AlbertaRylan J. Lundgren課題組發(fā)展了在簡(jiǎn)單的芳基醛催化下,利用*CO2實(shí)現(xiàn)了α-氨基酸的C1標(biāo)記過(guò)程。反應(yīng)對(duì)大多數(shù)蛋白質(zhì)氨基酸以及非天然氨基酸底物均可兼容。值得注意的是,利用此方法可以有效實(shí)現(xiàn)14C,13C或11C的標(biāo)記(Fig. 1c)。

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(圖片來(lái)源:Nat. Chem.

作者首先利用(±)-苯丙氨酸1作為模板底物進(jìn)行反應(yīng)嘗試,通過(guò)對(duì)催化劑、溶劑、堿、溫度等一系列參數(shù)進(jìn)行篩選,作者發(fā)現(xiàn)當(dāng)使用4-甲氧基苯甲醛(20 mol%),Cs2CO3(40 mol%),13CO2(1 atm,8 equiv),在DMSO中,70 ℃下反應(yīng)24 h可以以84 %的分離產(chǎn)率實(shí)現(xiàn)13C標(biāo)記的(±)-苯丙氨酸產(chǎn)物[13C]1的合成,且13C的標(biāo)記比例可以達(dá)到75%(Fig. 2a)。此外,作者對(duì)不同醛催化劑實(shí)現(xiàn)氨基酸羧基交換過(guò)程進(jìn)行動(dòng)力學(xué)分析。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明富電子或中性的芳基醛催化劑隨著時(shí)間的推移展現(xiàn)出更好的穩(wěn)定性,從而可以更好的實(shí)現(xiàn)羧基交換過(guò)程,而缺電子芳基醛催化劑雖然可以快速催化羧基交換過(guò)程,但其分解更快(Fig. 2b)。

值得注意的是,作者利用此方法還可以實(shí)現(xiàn)14C標(biāo)記過(guò)程,選用Ba[14C]CO3在標(biāo)準(zhǔn)條件下原位生成[14C]CO2,從而實(shí)現(xiàn)了14C標(biāo)記的(±)-苯丙氨酸產(chǎn)物[14C]1的合成(Fig. 2c)。

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(圖片來(lái)源:Nat. Chem.

接下來(lái),作者對(duì)此轉(zhuǎn)化的底物范圍進(jìn)行了考察(Table 1)。整體來(lái)講,利用此方法可以有效實(shí)現(xiàn)一系列蛋白質(zhì)氨基酸以及非天然氨基酸的13C標(biāo)記(1-37)。例如,烷基或芳基取代的α-氨基酸(苯丙氨酸,丙氨酸,亮氨酸,甘氨酸,酪氨酸,色氨酸,蛋氨酸)均可以以>50%的產(chǎn)率,31-75% 13C-標(biāo)記率實(shí)現(xiàn)13C標(biāo)記產(chǎn)物的合成(1-36-9)。具有酸性或堿性側(cè)鏈取代的底物同樣可以順利實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化,以23-68%的13C-標(biāo)記率實(shí)現(xiàn)產(chǎn)物(12-1416-17)的合成。值得注意的是,利用此方法可以方便的實(shí)現(xiàn)藥物ADME研究過(guò)程中同位素分子的合成。此外,該反應(yīng)具有良好的官能團(tuán)兼容性,包括鹵素(21-23),疊氮基(24),硝基(25),硼酸(26)等官能團(tuán)均可兼容,且芳基鹵化物的兼容性為后續(xù)的官能團(tuán)轉(zhuǎn)化提供了多種可能性。

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(圖片來(lái)源:Nat. Chem.

接下來(lái),作者通過(guò)稍微改變反應(yīng)條件,可以利用此策略,通過(guò)使用[11C]CO2直接實(shí)現(xiàn)α-氨基酸的11C標(biāo)記(Fig. 3)。由于11C原子的半衰期僅為20分鐘,因此需要在合成過(guò)程中事先生成亞胺羧酸鹽來(lái)實(shí)現(xiàn)11C的同位素標(biāo)記過(guò)程。利用此方法可以有效實(shí)現(xiàn)烷基、芳基以及含有極性側(cè)鏈取代的α-氨基酸((±)酪氨酸,

色氨酸,亮氨酸,蛋氨酸,賴氨酸和谷氨酰胺,以及(±)-甲狀腺素和谷胱甘肽)的11C標(biāo)記過(guò)程。

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(圖片來(lái)源:Nat. Chem.

為了深入理解反應(yīng)機(jī)理,作者進(jìn)行了一系列控制實(shí)驗(yàn)(Fig. 4)。首先,作者在H/D交換與羧基交換共存的條件下發(fā)現(xiàn)兩個(gè)過(guò)程均可發(fā)生。由此表明中間體i-1通過(guò)羧基化形成i-2的亞胺結(jié)構(gòu),而i-2則會(huì)形成標(biāo)記產(chǎn)物(Fig. 4a)。隨后,作者發(fā)現(xiàn)烷基胺的亞胺底物在標(biāo)準(zhǔn)條件下是不能發(fā)生羧酸化過(guò)程的(Fig. 4b)。接下來(lái),作者證實(shí)了羧酸的交換只能在可烯醇化的α-羧酸上發(fā)生(Fig. 4c)。最后,作者在4-溴苯丙氨酸22與苯乙醛縮合后的羧基交換過(guò)程中觀察到了[13C]22而未觀察到1。由此表明反應(yīng)中形成了丙二酸鹽中間體i-6而非氮雜烯丙基中間體i-7(Fig. 4d)。

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(圖片來(lái)源:Nat. Chem.

基于上述實(shí)驗(yàn)結(jié)果,作者提出了此轉(zhuǎn)化可能的反應(yīng)機(jī)理(Fig. 5)。首先,氨基酸可與醛催化劑縮合形成亞胺中間體。隨后通過(guò)堿促進(jìn)或互變異構(gòu)形成烯醇從而形成活性親核試劑,其可捕獲*CO2形成亞氨基戊酸酯中間體。此中間體可以通過(guò)脫羧重新形成烯醇中間體,其可以通過(guò)互變異構(gòu)或質(zhì)子化形成同位素標(biāo)記的亞胺。最后,亞胺可以被水解從而得到標(biāo)記的氨基酸產(chǎn)物。此外,作者認(rèn)為在整個(gè)催化循環(huán)中每個(gè)步驟均具有可逆性,因此與*CO2的交換效率應(yīng)該是熱力學(xué)控制的。而如果催化劑分解的速率比羧基交換的速率低的時(shí)候則會(huì)發(fā)生同位素標(biāo)記率低的現(xiàn)象。

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(圖片來(lái)源:Nat. Chem.

總結(jié)

加拿大渥太華大學(xué)Benjamin H. Rotstein和阿爾伯塔大學(xué)Rylan J. Lundgren課題組發(fā)展了在簡(jiǎn)單的芳基醛催化下,利用*CO2實(shí)現(xiàn)了α-氨基酸的14C,13C或11C標(biāo)記過(guò)程。反應(yīng)對(duì)大多數(shù)蛋白質(zhì)氨基酸以及非天然氨基酸底物均可兼容。利用此方法,無(wú)需對(duì)羧酸進(jìn)行預(yù)活化或在分子上預(yù)先安裝官能團(tuán),即可實(shí)現(xiàn)α-氨基酸碳同位素標(biāo)記,這在藥物研發(fā)和醫(yī)療領(lǐng)域中具有重要的應(yīng)用價(jià)值。


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