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JACS:分子骨架編輯——剔除碳原子,嘧啶變吡唑

來源:化學(xué)加原創(chuàng)      2022-12-22
導(dǎo)讀:分子骨架編輯最近成為有機(jī)化學(xué)領(lǐng)域熱門研究方向之一,其可以幫助化學(xué)家快速高效重構(gòu)分子骨架。其中,芝加哥大學(xué)化學(xué)新星Mark Levin教授和UC Berkeley 的Richmond Sarpong教授是這一研究領(lǐng)域的佼佼者。他們各自獨(dú)辟蹊徑,報道了許多令人驚嘆的研究成果。近日,UC Berkeley 的Richmond Sarpong課題組在著名化學(xué)期刊JACS上再次報道了自己的最新成果:通過形式上的碳原子剔除,實(shí)現(xiàn)了嘧啶變吡唑。這一突破可以讓作者在室溫條件下高效合成吡唑分子骨架。相關(guān)成果在線發(fā)表于 Journal of the American Chemical Society (DOI: 10.1021/jacs.2c10746)。

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截止到2014年,在美國食品藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)的最暢銷的200種藥物分子結(jié)構(gòu)中,含有至少一個氮雜原子的藥物分子占到了總數(shù)的59%。而這其中,嘧啶是最常見的二嗪(數(shù)量占比排第六位),吡唑是最常見的二唑。由于它們特殊的結(jié)構(gòu)性質(zhì),這些含氮雜環(huán)的引入對提高藥物分子的活性和多樣性通常是非常顯著的,例如,它們可以與生物靶標(biāo)形成諸如氫鍵的作用力來改善藥物活性。此外,針對這些雜環(huán)的后期結(jié)構(gòu)修飾也可以加快新型藥物和農(nóng)用化學(xué)品發(fā)現(xiàn)的步伐。而如果可以通過分子骨架編輯的手段直接對這類含氮雜環(huán)分子進(jìn)行骨架重塑,則可以有效避免化學(xué)家們?yōu)榱藢?shí)現(xiàn)分子改造而不得不重新設(shè)計分子合成路線的麻煩。與之形成鮮明對比的是,藥物分子骨架的直接編輯相對于外圍的分子改造是非常困難的,并且這一領(lǐng)域也是近些年才興起的(圖1A),可參考借鑒的經(jīng)驗(yàn)很少。

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圖1. 研究背景一 (圖片來源: J. Am. Chem. Soc.)

嘧啶雜環(huán)在C-H鍵活化領(lǐng)域是一種非常良好的導(dǎo)向基團(tuán),相對而言,吡唑類雜環(huán)卻是一種較差的導(dǎo)向基團(tuán),如果可以通過分子骨架編輯實(shí)現(xiàn)嘧啶變吡唑,則可以提供一種變相的吡唑?qū)虻腃-H鍵活化(圖1C);除此之外,通過分子骨架編輯將其它雜環(huán)轉(zhuǎn)化為嘧啶雜環(huán)已有報道,例如Morandi課題組報道了通過氮原子插入實(shí)現(xiàn)吲哚變喹唑啉(Science 2022377, 1104-1109),Levin課題組報道了碳卡賓插入吡唑N-N鍵生成2-芳基嘧啶(J. Am. Chem. Soc2022144, 19258-19264)。而通過分子骨架編輯合成吡唑卻鮮有報道。事實(shí)上,早在1968年,Van der Plas和Jongejan就發(fā)現(xiàn)在溶劑量的水合肼存在下將嘧啶加熱至200 °C可將其轉(zhuǎn)化成吡唑(圖2A)。然而在該條件下含有取代基的嘧啶無法轉(zhuǎn)化成吡唑。后來化學(xué)家們發(fā)現(xiàn)通過嘧啶N-甲基化降低嘧啶環(huán)的LUMO能量,從而提高水合肼的親核進(jìn)攻能力,進(jìn)而可實(shí)現(xiàn)在100 °C下將嘧啶變吡唑(圖2A)。盡管這種兩步反應(yīng)策略可以將反應(yīng)條件變的非常溫和,但是底物范圍仍然非常有限,并且需要用到溶劑量的碘甲烷。

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圖2. 研究背景二 (圖片來源: J. Am. Chem. Soc.)

考慮到該反應(yīng)的使用價值及前人的研究經(jīng)驗(yàn),作者設(shè)想能找到一種方法可以進(jìn)一步降低嘧啶雜環(huán)的LUMO能量,從而在更溫和的條件下實(shí)現(xiàn)嘧啶變吡唑,同時又能實(shí)現(xiàn)更廣的底物范圍。作者首先借助于計算機(jī)輔助策略來分析該設(shè)想的可行性(圖3)。他們發(fā)現(xiàn),嘧啶N-三氟甲磺酰化可以更高效地降低嘧啶LUMO能量,從而可以實(shí)現(xiàn)室溫條件下肼的親核進(jìn)攻。基于這種預(yù)測,他們隨后通過大量的優(yōu)化實(shí)驗(yàn),最終證實(shí)了三氟甲磺酸酐是一種非常有效的嘧啶活化劑(圖4),可以實(shí)現(xiàn)室溫條件下一鍋法嘧啶變吡唑。這種通過形式上的碳剔除方法可以將二嗪類雜環(huán)轉(zhuǎn)化為FDA批準(zhǔn)的藥物中最常見的二唑。

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圖3. 反應(yīng)機(jī)理研究 (圖片來源: J. Am. Chem. Soc.)

文中,作者首先詳細(xì)的分析了該反應(yīng)可能的機(jī)理。首先,在選擇性上,空間位阻最小的嘧啶氮原子更容易進(jìn)行三氟甲磺?;é? ≈ 0.99 kcal/mol;圖3A)。這一選擇性也進(jìn)一步通過4-苯基嘧啶的甲基化實(shí)驗(yàn)(1a,圖 3C)和通過計算得到的Fukui親核指數(shù)(圖3D)予以證實(shí)。隨后親核性的肼進(jìn)攻活化嘧啶的C-6位得到中間體C。DFT計算發(fā)現(xiàn)此步為限速步(圖3)。同時,作者發(fā)現(xiàn)在此階段,較低溫度下脫三氟甲磺?;欠浅o@著的副反應(yīng),會嚴(yán)重降低反應(yīng)的收率(圖 3A)。具有較高酸性的中間體C去質(zhì)子化得到中間體D,隨后開環(huán)得到中間體E。通過互變異構(gòu)之后得到的中間體F的末端氮原子與C-4反應(yīng)關(guān)環(huán)形成中間體G。隨后通過質(zhì)子轉(zhuǎn)移和1,5-sigmatropic氫遷移消除三氟甲基甲脒基團(tuán),生成最終的吡唑產(chǎn)物。

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圖4. 反應(yīng)條件優(yōu)化 (圖片來源: J. Am. Chem. Soc.)

得到最佳反應(yīng)條件后,作者探索了該反應(yīng)的底物適用性。如圖5A所示,對比2a2b的收率可以發(fā)現(xiàn),該反應(yīng)可以兼容不同電性的苯環(huán)。芳環(huán)鄰位和間位取代的衍生物具有相似的反應(yīng)活性(3a3b4a4b)。同時,該反應(yīng)也可以非常好的兼容鹵素取代基(56)。需要特別指出的是,嘧啶環(huán)上也可以好的兼容各類雜環(huán)(產(chǎn)物7-10)。隨后作者進(jìn)一步探究了嘧啶環(huán)本體的官能團(tuán)兼容性(圖5B)。作者發(fā)現(xiàn)該反應(yīng)可以很好的兼容各類取代基,如給電子基團(tuán)(19、苯環(huán)(22、鹵素(2425)和氰基(26)等。需要指出的是,吸電子取代基的存在往往會降低反應(yīng)效率(24-27)。最后,作者嘗試合成了一系列N-1位有取代的吡唑類衍生物(圖5C)。通過對比可以發(fā)現(xiàn),相對于沒有取代的肼,苯基取代肼反應(yīng)活性往往會降低很多,這可能是由于取代基的存在降低了肼的親核活性。

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圖5. 底物范圍 (圖片來源: J. Am. Chem. Soc.)

與此同時,作者發(fā)現(xiàn),對反應(yīng)條件稍加優(yōu)化,該反應(yīng)也可以兼容游離的羥基和氨基(圖6A)。為了證明該反應(yīng)的實(shí)用性,作者直接對結(jié)構(gòu)相對復(fù)雜的藥物分子進(jìn)行骨架編輯(圖6C)含有嘧啶環(huán)的藥物衍生物如benzpyrimoxan,F(xiàn)enarimol,Rivaroxaban等都可以以好的收率轉(zhuǎn)變?yōu)楹吝蝾惖慕Y(jié)構(gòu)。最后,作者通過連續(xù)的嘧啶導(dǎo)向的C-H鍵活化和嘧啶分子骨架編輯,順利合成Celecoxib衍生物(圖6D)。具體而言,采用4-苯基嘧啶類底物44為起始原料,利用嘧啶環(huán)的導(dǎo)向能力,以定量收率實(shí)現(xiàn)金屬釕催化的C-H鍵雙芳基化(45,100% 收率),進(jìn)而采用本文報道的條件,實(shí)現(xiàn)碳原子剔除,嘧啶變吡唑,以53%的收率合成了Celecoxib衍生物(46)。

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圖6. 合成應(yīng)用 (圖片來源: J. Am. Chem. Soc.)

總結(jié)

加州大學(xué)伯克利分校Sarpong教授課題組報道了通過形式上的碳原子剔除實(shí)現(xiàn)嘧啶變吡唑。該反應(yīng)是Sarpong教授在分子骨架編輯領(lǐng)域的又一力作,展示了“單原子”骨架編輯的概念。該反應(yīng)條件溫和,底物范圍廣泛,可以被很好的應(yīng)用于復(fù)雜藥物分子的直接編輯。該方法還提供了獲得各種N2取代吡唑的途徑,而這些取代的二唑在C-H鍵官能團(tuán)化中的定向能力差且通過取代的區(qū)域選擇性官能團(tuán)化制備它們極其困難。


文獻(xiàn)詳情:

Bartholomew, G. L.; Carpaneto, F.; Sarpong, R. Skeletal Editing of Pyrimidines to Pyrazoles by Formal Carbon Deletion. J. Am. Chem. Soc. 2022, https://doi.org/10.1021/jacs.2c10746

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