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上海交通大學(xué)李健課題組JACS:化學(xué)酶法實現(xiàn)Labdane型骨架氧化態(tài)自由

來源:上海交通大學(xué)      2024-09-24
導(dǎo)讀:近日,上海交通大學(xué)李健課題組在JACS上發(fā)表了題為:“Chemoenzymatic Oxidation of Labdane and Formal Synthesis of Nimbolide”的研究論文,綜合運(yùn)用酶庫篩選、定向進(jìn)化和連續(xù)化學(xué)氧化實現(xiàn)了labdane型骨架母核的全面氧化。此外,為了展示化學(xué)酶法氧化在實際合成中的可行性以及線性合成復(fù)雜天然產(chǎn)物的潛力,李健團(tuán)隊完成了nimbolide形式合成。


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正文

選擇性C-H氧化反應(yīng)代表著有機(jī)合成中最重要也最具挑戰(zhàn)的轉(zhuǎn)化,化學(xué)法實現(xiàn)選擇性C-H氧化反應(yīng)大多需要借助導(dǎo)向基實現(xiàn)。相較于化學(xué)方法,酶催化的C-H氧化既擁有高選擇性,也展示出對官能團(tuán)的低依賴與高兼容性。值得一提的是,底物在無保護(hù)基的前提下就可能實現(xiàn)酶的連續(xù)C-H氧化。考慮到上述優(yōu)點(diǎn),逆合成分析中,使用生物催化引入氧化態(tài)的方式受到了學(xué)術(shù)界與工業(yè)界的廣泛關(guān)注。在天然產(chǎn)物中,具有較高活性的分子往往也是相應(yīng)家族中氧化態(tài)較高的分子。以labdane及相近的drimane骨架為例,具有生物活性的化合物如nimbolide和forskolin相較于沒有氧化態(tài)的母核(化合物19, 圖1),分別具有6個和9個氧化態(tài)。為了實現(xiàn)labdane型骨架氧化態(tài)的引入,許多課題組使用化學(xué)或生物催化的手段對商業(yè)易得的香紫蘇內(nèi)酯、香紫蘇醇和降龍涎香進(jìn)行了C-H氧化的嘗試并且取得了不錯的效果(圖1)。然而,由于不同方法適用底物不同,在同一個底物上連續(xù)引入氧化態(tài)仍然存在巨大的挑戰(zhàn)。

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圖1:部分labdane型與杜馬烷型骨架天然產(chǎn)物與labdane型骨架C-H氧化研究進(jìn)展

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圖2:化合物1, 2, 3, 18, 19的酶庫篩選結(jié)果

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圖3:化合物20的酶庫篩選結(jié)果

為了實現(xiàn)酶和化學(xué)方法的連續(xù)氧化,李健團(tuán)隊首先對六個具有labdane型骨架的,商業(yè)可得或易于制備的化合物(123181920, 圖2)進(jìn)行了酶庫的篩選,并最終選取了氧化產(chǎn)品更豐富的脫氫香紫蘇內(nèi)酯(20, 圖3)作為底物,展開了后續(xù)定向進(jìn)化與連續(xù)氧化的嘗試。

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圖4:α-KG依賴的雙加氧酶AndA的定向進(jìn)化。a. AndA野生型的定向進(jìn)化。b. 天然底物與AndA野生型共晶中的結(jié)合姿態(tài)與活性位點(diǎn)氨基酸殘基。c. 本報道中9,11-脫氫香紫蘇內(nèi)酯酶法C-H氧化的總結(jié)

由于AndA對脫氫香紫蘇內(nèi)酯氧化效率低,通過分析已知文獻(xiàn)報道的AndA的晶體(圖4b),李健團(tuán)隊首先選取酶活性中心附近的三個大位阻氨基酸(69與70位的異亮氨酸和139位的亮氨酸)進(jìn)行了飽和突變。其中,69位異亮氨酸突變成酪氨酸后,AndA的轉(zhuǎn)化率明顯提升,且生成C6α羥基的產(chǎn)品?;谠撏蛔凅w,對120號氨基酸和138號氨基酸進(jìn)行飽和突變,分別得到了單一的C6α羥基和C1α羥基的產(chǎn)品3837(圖4a)。至此,李健團(tuán)隊實現(xiàn)了脫氫香紫蘇內(nèi)酯C1、C2、C3、C5和C6位點(diǎn)的選擇性氧化(圖4c)。

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圖5:基于化合物20的酶法和化學(xué)接力氧化

在得到上述氧化產(chǎn)品以及實現(xiàn)位點(diǎn)選擇性氧化的酶后,李健團(tuán)隊綜合運(yùn)用酶法和化學(xué)方法連續(xù)氧化,得到如圖5所示的二十個基于脫氫香紫蘇內(nèi)酯的多位點(diǎn)全面氧化的產(chǎn)品。其中,化合物38可以通過Suarez和AndA突變體的C-H氧化得到具有nimbolide A/B環(huán)骨架與C1氧化態(tài)的中間體55。

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圖6:無保護(hù)基的Nimbolide形式合成

為了展示化學(xué)酶法C-H氧化的可行性,李健課題組選取化合物55作為前體,經(jīng)過9步,實現(xiàn)了nimbolide的形式合成(圖6)。


總結(jié)

綜上所述,李健團(tuán)隊通過酶庫篩選與定向進(jìn)化實現(xiàn)了脫氫香紫蘇內(nèi)酯位點(diǎn)選擇性的C-H氧化。在確定這些功能獨(dú)特的酶后,綜合運(yùn)用酶和化學(xué)方法在單氧化態(tài)產(chǎn)品上連續(xù)氧化,得到了二十個脫氫香紫蘇內(nèi)酯全面氧化的衍生物。這種協(xié)同氧化的策略實現(xiàn)了labdane型骨架A/B環(huán)系所有位點(diǎn)氧化態(tài)的精準(zhǔn)引入。通過使用中間體55,李健團(tuán)隊實現(xiàn)了nimbolide高效形式合成。這種整合了酶庫篩選、定向進(jìn)化與化學(xué)轉(zhuǎn)化的變革性的逆合成策略為構(gòu)筑其他具有復(fù)雜氧化態(tài)的萜類、甾體和生物堿類天然產(chǎn)物提供了范例。


作者簡介

李健,上海交通大學(xué)變革性分子前沿科學(xué)中心長聘教軌副教授,博士研究生導(dǎo)師。博士畢業(yè)于上海有機(jī)所(導(dǎo)師:李昂研究員),后在美國斯克里普斯研究所從事博士后研究工作(合作導(dǎo)師:Hans Renata教授)。2022年加入上海交通大學(xué)變革性分子前沿科學(xué)中心,獲評國家海外高層次青年人才。目前已在Nature ChemistryJACS、Angewandte Chemie、Nature Communication等學(xué)術(shù)刊物發(fā)表論文20余篇。研究領(lǐng)域:天然產(chǎn)物化學(xué)酶法合成、手性藥物化學(xué)酶法合成和蛋白質(zhì)定向進(jìn)化。

課題組主頁:lilabsjtu.com

根據(jù)課題組發(fā)展需要,2025年擬招聘天然產(chǎn)物全合成方向博士研究生2名,酶學(xué)或發(fā)酵工程方向博士研究生1名。有意應(yīng)聘者請將簡歷發(fā)送到電子郵箱:jianlizcz@sjtu.edu.cn

文獻(xiàn)詳情:

Chemoenzymatic Oxidation of Labdane and Formal Synthesis of Nimbolide
Xiaotao Liu, Yaoyao Xu, Lingling Li, Jian Li*
J. Am. Chem. Soc. 2024

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c07956

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